Preimplantasyon genetik tanı testinin tedavi amacıyla uygulama alanlarından birisi de, ailede kök hücre nakli gerekçesi olan bir hastalıklı çocuk varlığında, doku uyumluluk antijeni (HLA) uyumlu embriyonun seçilmesi amacıyla yapılan şeklidir. Kemik iliği veya kordon kanı kök hücrelerinin nakli ile tedavi edilebilen çocukluk çağı hastalıklarında, ailede veya yakın akrabalarında uygun bir donör bulunamadığı durumlarda, tüp bebek uygulamasının ardından elde edilen embriyolarda PGT tekniği ile HLA tiplemesi yapılmaktadır.
Anne ve baba adayından ve hasta çocuklarından kan veya herhangi bir doku örneği alınarak gerekli genetik değerlendirmeler yapılır. Tüp bebek aşamaları sonrasında elde edilen embriyolar, kök hücre nakli planlanan hasta kardeş ile HLA uyumu yönünden incelenir. HLA uyumu saptanan sağlıklı embriyolar arasından seçim yapılarak rahim içerisine transfer gerçekleştirilir. HLA uyumlu embriyo transferi sonrası oluşmuş gebelik ve sağlıklı doğum sonrası alınan kordon kanı kök hücreleri ya da bebeğin belirli bir gelişim düzeyine geldiğinde alınabilecek kemik iliği kök hücreleri ile hasta kardeşin tedavisi sağlanabilir.